Третья передача включается иногда с хрустом на Вольво Эс60?

Проблема может быть например в синхронизаторе, в шестерне третьей скорости, нужно проводить дефектовку мкпп.

Если только «иногда», тогда скорее всего коробка передач в порядке.
Надо проверить регулировку привода переключений передач. И последите за своими действиями, может «иногда» при включении третьей передачи, вы делаете не полный выжим педали сцепления.