Машина простояла 2 суток наполовину в воде

Нужно просушить и продуть все разъемы, всю электронику, заменить фильтра и масла, выкрутить свечи и продуть цилиндры, потом уже пробовать запустить двигатель.

Если вода затопила мотор, тогда конечно его надо в первую очередь, освободить от воды, открутив и поддон двигателя (так как там в любом случае остаётся часть старого масла, а в данном случае останется вода).
В свечные отверстия залить немного моторного масла, покрутить колен/вал два-три оборота. Смажутся цилиндры в это время, выйдут остатки воды из масляного насоса и из полостей коленвала. Открутить масляный фильтр, там тоже скорее всего вода. Без фильтра, в открывшуюся полость продуть сжатым воздухом масляные каналы (наверняка выдуется ещё часть воды).
Затем можно вкрутить новый фильтр, прикрутить масляный поддон и заливать свежего масла. Система охлаждения если не пострадала, тогда там только проверить уровень в расширительном бачке, что бы туда не попала грязная вода.
Далее выпускная система. Там если стоит вода, то желательно её выпустить, иначе она может сработать как затычка и газы не смогут выйти, мотор или не запустится или будет глохнуть. Допустим вода всё ещё стоит какой-то уровень и затапливает глушитель, тогда приподнять авто на домкратах можно попробовать, что бы вода слилась. Если воды осталось мало в глушителе, тогда её выдует газами.
Когда сделали этот минимум обслуживания, только тогда имеет смысл запускать двигатель стартером.

Если все эти работы по приведению в порядок двигателя, невозможно сделать на месте, тогда надо вызывать эвакуатор. Или на буксире куда-то на более сухое место.