Может ли в маховик авто попасть осколок камня?

Проверьте снизу, не открыто ли отверстие в кпп, где видно маховик. Причина может быть например в самой мкпп. 

Снимать КПП и смотреть проблему визуально

За 20 л не видел ни одного камня в сцеплении, вы пишите что уже второй раз. Пружины да лопаются и осколки пружин мешают выжиму или обратному возвращению — сцепление ведет.