Двигатель Хонда Одиссей, жестко работает после ремонта

До ремонта не замечали, не запомнили как стояли метки ГРМ? На один зуб возможно ошиблись, метку распредвала переместите на один зуб против часовой, мотор заработает мягче, проверьте тщательно.

Нужно вам проверить совмещение. Я всегда совмещаю два распредвала в нижней точке, когда меняются режимы, заканчивается выхлоп — начинается всасывание. Особенно на Тойотах, звездочки, как правило, на один зуб начинают не совпадать. Из-за износа. Проверяйте внимательно на совмещение, возможно только один вал не будет стоять по метке(это маленький проффессиональный секретик). Только каждый раз, не ленитесь проворачивать вал в сборе, вручную(не заводить пока не будете уверены).

Скорее всего выработка на шейках распредвала — вот и тарахтит + потеря давления масла в ГБЦ

Про выработку в гильзах ни чего не ответили, какая выработка? И как выглядит юбка поршня. Если есть выработка в гильзе, и юбка поршня блестит как зеркало, без характерных рисок на юбке, то нужен был полный ремонт. Так как вы трогали поршня, такой звук двигателя появляется(как трактор работает). Поршня за счет нагара в гильзах работали тише, теперь юбка поршня при вращении вала бьет по стенке гильзы. Без ремонтных поршней и расточки гильз шум не уйдет.